このpodcastは、さまざまな形で分子デザインに携わるメンバーが、分子デザインについてゆるく語りつつ情報発信する番組です。タンパク質デザインや核酸 (DNA/RNA)デザインが主なトピックです。 https://teapaw.org/t.co/exoA73iawc
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【📢お知らせ📢】
Podcast「#分子デザインはじめました」のホームページを公開しました🎉
・エピソードごとにPodcast、YouTube、ショーノートを1ページに集約
・トップのキーワード検索で気になるエピソードを検索できます
聴きたい形式で、聴きたい回からぜひ！
▶︎ sites.google.com/view/podcas…
分子デザインはじめました (Podcast) retweeted
こちらのProteína-Complexa、南慎太朗さん@shintaro_minami が手軽に試せるColab notebook版を公開され、私たちのPodcastでそのチュートリアルを配信しましたので、気になった方はぜひ！
ちなみに構造と配列の同時生成は「co-design = コデザイン」がより正確な表記ですね！
teapaw.org/Biomol_Design/status/2…
Nvidiaのタンパク質デザインツール
構造とアミノ酸配列を同時生成する「コードデザイン」と、最適な候補を絞り込む「潜在生成検索」を組み合わせたNvidiaのProteína-Complexa実証論文。これまで困難だった糖鎖などの標的に対するバインダー生成などを可能に
biorxiv.org/content/10.64898…
Ep26-3: [Hands-on] Proteina Complexa tutorial を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
南慎太朗さん @shintaro_minami をゲストに、NVIDIAの最新バインダー生成モデルであるProteina Complexa について、南さん作成のColab Notebookに沿ったチュートリアルを収録しました。
今回から、ハンズオンの動画を Youtube でも公開しています！ぜひチャンネル登録をお願いします！
Youtube チャンネル「分子デザインはじめました」
youtube.com/channel/UCuDtDoN…
Ep26-3: [Hands-on] Proteina Complexa tutorial
youtube.com/watch?v=b9cXLQNn…
分子デザインはじめました (Podcast) retweeted
南さんインタビュー後半です！
AIエージェントを使ったデザインプロジェクト管理のTipsやデザイン手法開発の今後について話しました！
Ep 26-2: [Interview] Shintaro Minami (Accipiter Biosciences) “Design at Scale" を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
南慎太朗さん @shintaro_minami インタビュー回後編です！前編に続き、AIエージェント、スキル、MCP、プロジェクト管理、構造予測モデルの展望などについて伺いました。
分子デザインはじめました (Podcast) retweeted
南さんインタビュー後編！！Claude codeで設計ツールなどを作っていた最中の収録でとても勉強になりました！！Obsidianはまだ手が出せていません。(その後、Claude codeを回していたデスクトップPCが2台同じエラーで壊れるという…。)
Ep 26-2: [Interview] Shintaro Minami (Accipiter Biosciences) “Design at Scale" を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
南慎太朗さん @shintaro_minami インタビュー回後編です！前編に続き、AIエージェント、スキル、MCP、プロジェクト管理、構造予測モデルの展望などについて伺いました。
分子デザインはじめました (Podcast) retweeted
Podcast #分子デザインはじめました、南さんインタビュー回の後編がリリースになりました！
バインダーのリデザインの話から、構造予測モデルの今後、タンパク質の配列・構造・機能の関係、構造をとらないタンパク質の扱いなど、情報と物質の狭間のお話が大変勉強になりました！
Ep 26-2: [Interview] Shintaro Minami (Accipiter Biosciences) “Design at Scale" を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
南慎太朗さん @shintaro_minami インタビュー回後編です！前編に続き、AIエージェント、スキル、MCP、プロジェクト管理、構造予測モデルの展望などについて伺いました。
Podcast #分子デザインはじめました、Apple Podcasts にも対応し、Spotify、Apple Podcasts、Pocket Casts、Overcast など各種アプリでお聴きいただけます！
各種デザイン手法、論文、実験機器などへのリンクは show note から。気になるところからのご視聴に、チャプターもご利用ください！
Ep 26-2: [Interview] Shintaro Minami (Accipiter Biosciences) “Design at Scale" を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
南慎太朗さん @shintaro_minami インタビュー回後編です！前編に続き、AIエージェント、スキル、MCP、プロジェクト管理、構造予測モデルの展望などについて伺いました。
分子デザインはじめました (Podcast) retweeted
Podcast で南慎太朗さんにインタビューさせていただきました！
最新のタンパク質デザイン手法やクラウドコンピューティングの活用、バイオスタートアップでの働き方や、３年分を１ヶ月でというスピード感などなど、大変勉強させていただきました！
近日公開予定の後編もぜひ！
Ep 26-1: [Interview] Shintaro Minami (Accipiter Biosciences) “Design at Scale" を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
南慎太朗さん @shintaro_minami をゲストに、米国スタートアップでのタンパク質デザイン、最新のデザインツール、vibe coding や cloud computing について伺いました。
分子デザインはじめました (Podcast) retweeted
De novoタンパク質デザインによる創薬の最前線で活躍されている南さんにお話伺いました！
気になる最新デザイン関連手法や、新しい手法を取り入れる時どうしているかなど、実践的な内容も盛りだくさんの回になっております！
Ep 26-1: [Interview] Shintaro Minami (Accipiter Biosciences) “Design at Scale" を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
南慎太朗さん @shintaro_minami をゲストに、米国スタートアップでのタンパク質デザイン、最新のデザインツール、vibe coding や cloud computing について伺いました。
Ep 26-1: [Interview] Shintaro Minami (Accipiter Biosciences) “Design at Scale" を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
南慎太朗さん @shintaro_minami をゲストに、米国スタートアップでのタンパク質デザイン、最新のデザインツール、vibe coding や cloud computing について伺いました。
分子デザインはじめました (Podcast) retweeted
ちょっと期間が空いてしまいましたが、新エピソードです！tips紹介は、既存製品とかとのconflictもあるので、カットの判断が難しかったです笑
この回の後からClaude codeを使い始めて、独自？の設計パイプラインを考えて実行したりしています。電子実験ノートも自作したので、どこかでお話しできれば。
Ep 25: [Tips] Pipettes and Pro Tips を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
科学大の浜田さんをゲストMCに迎え、DNAゲル分子ロボのデザインに関する最新の成果についてご紹介いただきました。また、podcast 初の試みとして、分子デザインを検証する際の Wet lab の Tips について話しました。
分子デザインはじめました (Podcast) retweeted
Podcast #分子デザインはじめました、今回のエピソードで、2年続けることができました！聞いてくださる方と、出演いただいたゲストの皆様に感謝🙇♂️
今回は実験 tips！時流は、自動化・並列化・アウトソースだなぁと思う回でした。
Ep 25: [Tips] Pipettes and Pro Tips を公開しました！
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科学大の浜田さんをゲストMCに迎え、DNAゲル分子ロボのデザインに関する最新の成果についてご紹介いただきました。また、podcast 初の試みとして、分子デザインを検証する際の Wet lab の Tips について話しました。
分子デザインはじめました (Podcast) retweeted
新エピソードです！
ついに私イチオシのRaininのマルチチャネルピペットを紹介する機会がやってきました笑
デザインを実験室で評価する際のTipsはまだまだありそうなので今後も定期的にやっていきたいですね！
Ep 25: [Tips] Pipettes and Pro Tips を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
科学大の浜田さんをゲストMCに迎え、DNAゲル分子ロボのデザインに関する最新の成果についてご紹介いただきました。また、podcast 初の試みとして、分子デザインを検証する際の Wet lab の Tips について話しました。
Ep 25: [Tips] Pipettes and Pro Tips を公開しました！
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科学大の浜田さんをゲストMCに迎え、DNAゲル分子ロボのデザインに関する最新の成果についてご紹介いただきました。また、podcast 初の試みとして、分子デザインを検証する際の Wet lab の Tips について話しました。
Ep 24: [Journal] Membrane Protein Designs を公開しました。
open.spotify.com/show/1QHT8n…
理研の新津藍さん @AiNiitsu212 、岡本 @Okamoto_Yasu_CH 本田 @akg_entrance 松林 @Matsubayashi_Jで、膜タンパク質デザインの論文４報についてジャーナルクラブを行いました。
分子デザインはじめました (Podcast) retweeted
本podcastも3年目突入！そんな今回のゲストは以前からお声がけしていた@NaohiroTerasakaさん！
あらためて分子進化の強力さを再認識しました。独自の進化技術を確立した寺坂ラボの今後に要注目です！Don’t think (too much) but evolve it!
Ep 23: [Interview] Naohiro Terasaka (Science Tokyo) “Just Evolve it!” を公開しました！
open.spotify.com/show/1QHT8n…
科学大の寺坂尚紘さん @NaohiroTerasaka に、RNA研究から始まったキャリア、HFSPでのスイス留学、タンパク質進化分子工学、独立後の in vitro 進化系の技術開発などを伺いました。