teapawtteapawt
  • Timeline
  • Grid
  • Gallery
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogSep 15
【新記事公開!】 MLIPはどれを選べばよい? MLIP Arenaで学ぶ、ベンチマークの読み方 labo-code.com/materials-info… 複数のMLIPを、解離曲線・状態方程式・MD安定性などからどう比較し、候補を絞るかを初心者向けに解説しました。 ランキングだけで決めず、自分の系で確かめる手順も紹介しています。ぜひご覧ください! #材料情報学 #計算化学 #MLIP
6
760
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogJul 2
Pythonで複雑な金属触媒モデルのCIFファイルを構築する手順の解説動画が公開されました! CO2還元反応の触媒モデルとして、クラスター配置、可視化、幾何チェックをPythonで確認できます! ▶︎ 動画はこちら youtu.be/SekB1vO1Vyc #LabCode #機械学習ポテンシャル #バイオインフォ
6
1,323
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogJun 30
UMAを用いたMOFの吸着エネルギー評価を、Pythonコードとともに学べる解説動画が公開されました。 剛直モデルと柔軟モデルの扱い、寄与の分解、吸着エネルギー算出の流れを確認できます。 ▶︎ 動画はこちら youtu.be/sawSpx32OyI #LabCode #機械学習ポテンシャル #バイオインフォ

【機械学習ポテンシャル入門 #6】UMAを用いたMOF(金属有機構造体)の吸着エネルギーを計算する実践的評価方法

研究に使えるプログラミングの情報を発信しているLabCode(ラボコード)です! 今回はUMAでMOFの吸着エネルギーを計算!剛直...

youtube.com
3
773
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogJun 28
MOF構造データを読み込み、ゲスト分子CO2を配置するPythonモデリング手順の解説動画が公開されました。 ASEやpymatgenを使い、分率座標での配置、2Dスナップ、原子の衝突検知まで確認できます。 ▶︎ 動画はこちら youtu.be/l2OfmA6Hw1k #LabCode #機械学習ポテンシャル #バイオインフォ

【機械学習ポテンシャル入門 #5】MOFの構造データの読み込みからゲスト分子(CO2)の配置までを行う実践的なモデリング手順

研究に使えるプログラミングの情報を発信しているLabCode(ラボコード)です! 今回はPythonで実践!MOFモデリング入門 ...

youtube.com
3
686
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogJun 27
MOFのCIF作成に向けて、RDKitからASEへ分子データを変換する事前準備の解説動画が公開されました。 ASE × RDKit × pymatgenで、合成CIF作成に向けたモデリングの土台を確認できます! ▶︎ 動画はこちら youtu.be/mz9rtV4bN-g #LabCode #機械学習ポテンシャル #バイオインフォ

【機械学習ポテンシャル入門 #4】MOFのCIF作成に向けた事前準備:RDKitからASEへのデータ変換

研究に使えるプログラミングの情報を発信しているLabCode(ラボコード)です! 今回は【Pythonで計算化学】MOFのCIF作...

youtube.com
3
1,083
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogJun 26
機械学習ポテンシャルUMAとASEで分子の構造最適化を行う手法の解説動画が公開されました。 FAIR Chem Calculatorによるモデルロードから、β-カロテンの最適化、PySCF連携までを扱う実践入門です! ▶︎ 動画はこちら youtu.be/oNGL2_VBY1I #LabCode #機械学習ポテンシャル #バイオインフォ

【機械学習ポテンシャル入門 #3】UMAとASEで分子の構造最適化を実践!PySCF連携まで

研究に使えるプログラミングの情報を発信しているLabCode(ラボコード)です! 今回は【計算化学】機械学習ポテンシャルUMAとA...

youtube.com
3
13
3,598
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogJun 9
汎用機械学習ポテンシャル「UMA」の解説動画を公開しました。 有機分子から固体まで1つのモデルで扱えるUMAの特徴から、タスク選定、つまずきやすいポイント、ライセンスの注意点までわかりやすく解説しています。 ▶︎ 動画はこちら youtube.com/watch?v=H2rVHR0j… #LabCode #機械学習ポテンシャル #バイオインフォ
5
996
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogJun 5
機械学習ポテンシャルで分子の構造最適化をPython実装する手法の解説動画が公開されました。 Google Colab × TorchANI × ASEで始める機械学習ポテンシャル入門です! ▶︎ 動画はこちら youtube.com/watch?v=-UJpuXb6… #LabCode #機械学習ポテンシャル #バイオインフォ

【機械学習ポテンシャル入門 #1】PythonとASEで始める分子の構造最適化

研究に使えるプログラミングの情報を発信しているLabCode(ラボコード)です! 今回は【機械学習ポテンシャル入門】Pythonと...

youtube.com
1
19
2,498
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogApr 1
創薬研究の効率が劇的に向上!機械学習と強化学習を組み合わせた「環状ペプチド」の自動探索フローが公開されました。ランダム探索の限界を突破し、最短距離で有望な配列を特定する最新手法をチェック。 #創薬 #AI #バイオデジ youtu.be/z5jzpYJh3fU
3
9
1,016
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogMar 31
ペプチド創薬を劇的に変える「mobius」活用ガイド公開!ベイズ最適化を駆使し、数千億通りの組合せから最適解を高速抽出する最新手法を解説。インシリコスクリーニングの実践術を今すぐチェック。 #創薬AI #Python #新着動画 youtu.be/oudfUwiseR0

【ペプチド創薬 #10】【創薬AI】mobiusとベイズ最適化でペプチド探索を効率化!in silicoスクリーニング実践ガイド

研究に使えるプログラミングの情報を発信しているLabCode(ラボコード)です! 今回は【創薬AI】mobiusとベイズ最適化でペ...

youtube.com
3
7
882
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogMar 30
数千の候補から有望な環状ペプチドを爆速で探索!HELM形式とAutodock CrankPepを活用したin silicoスクリーニング手法の解説動画が公開されました。創薬研究を劇的に効率化する最新技術を今すぐチェック。 #創薬 #バイオインフォ #新着動画 youtu.be/lsGcByjW8fo
3
7
1,009
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogMar 29
ペプチド創薬の解析手法を更新!PRODIGYで環状ペプチドとタンパク質の結合エネルギー(ΔG・Kd)を算出。ドッキングの良し悪しを数値で客観的に判断する最新フローを公開しました。 #創薬 #バイオ #新着動画 youtu.be/4eNkGdlnR2k
3
11
1,548
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogMar 28
創薬研究の最前線で使われる「AutoDock CrankPep」の徹底解説動画が公開されました。WSLでの環境構築から、実際のシミュレーション実行手順まで、プロの視点で全行程をナビゲート。最新の解析手法を今すぐチェック! #創薬 #AutoDock #新着動画 youtu.be/7209XD3tJGM

【ペプチド創薬 #7】【創薬研究】環状ペプチドの分子ドッキング!AutoDock CrankPepの使い方と環境構築【WSL/Ubuntu】

研究に使えるプログラミングの情報を発信しているLabCode(ラボコード)です! 今回は【創薬研究】環状ペプチドの分子ドッキング!...

youtube.com
2
5
964
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogMar 27
ブラウザ完結で「環状ペプチド」の構造予測が可能に!Google Colabを活用したAlphaFold2の最新解析手法が公開されました。高価なGPUサーバー不要で、研究の効率が劇的に向上。手順を詳しく解説。 #創薬 #AlphaFold2 #最新技術 youtu.be/lelckNB0kzI

【ペプチド創薬 #6】【ブラウザで完結】AlphaFold2で環状ペプチドの構造予測!Google Colabを使った解析手順

研究に使えるプログラミングの情報を発信しているLabCode(ラボコード)です! 今回は【ブラウザで完結】AlphaFold2で環...

youtube.com
2
3
1,015
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogMar 26
タンパク質の形から配列を逆算する最新AI「ProteinMPNN」の解説動画を公開!従来比で圧倒的に高速・高精度な設計が可能です。創薬研究を劇的に変える技術の導入手順を最速チェックしましょう! #創薬 #AI #バイオレクエイム youtu.be/BOQNzECuyY8

【ペプチド創薬 #5】【構造から配列を設計】ProteinMPNNの環境構築と使い方

研究に使えるプログラミングの情報を発信しているLabCode(ラボコード)です! 今回は【構造から配列を設計】ProteinMPN...

youtube.com
3
10
942
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogMar 25
創薬AI「RFPeptide」の実践ガイドが公開!環境構築からタンパク質構造設計、可視化までの一連の流れを徹底解説。最新のペプチド創薬技術を効率的に学びたい研究者・エンジニア必見の内容です。 #創薬AI #RFPeptide #新着動画 youtu.be/k413RGUXeh4

【ペプチド創薬 #4】【創薬AI】RFPeptideの使い方!タンパク質構造設計から結果の可視化

研究に使えるプログラミングの情報を発信しているLabCode(ラボコード)です! 今回は【創薬AI】RFPeptideの使い方!タ...

youtube.com
2
13
1,443
LabCode(ラボコード)
@LabCodeBlogMar 25
創薬AIに革命。次世代のペプチド構造設計ツール「RFPeptide」の解説動画が公開されました。画像生成で話題の「拡散モデル」を応用し、ターゲットタンパク質に最適な結合骨格を自動生成。設計プロセスの高速化が期待されます。 #創薬AI #新技術 #バイオデジ youtu.be/N30-Z3iJ0Uk
3
9
1,024
Load more