
food and gut #microbionaut | #microbiota #microbiome | research scientist @INRAE_France | https://xitter.cf/t.co/6XWvNKYfuh
France
Joined October 2010
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😊Very happy to see this study out, "Global #branches and local states of the human gut #microbiome define associations with environmental and intrinsic factors" @veiga_pat @muriel_derrien @KnightLabNews nature.com/articles/s41467-0… – at Paris, France
your #microbiome
Je suis dans le bus 399 Juivisy @ClientsRATP Une dame rentre avec sa poussette à l arrière du bus. Elle a sa carte de transport. Les controleurs qui sont dans le bus la verbalise. c'est inadmissible. alors qu elle est de bonne foi. je soupçonne un peu de racisme en +. une honte!
Julien Tap retweeted
Meet Mistral Large 4, aka Le Chonk.
• 1T parameters, natively multimodal. 49B active.
It is the best open weights model from US or Europe on aggregated benchmarks.
• State-of-the-art on critical workloads, including cyber defense, manufacturing and finance and it surpasses closed frontier models on visual grounding.
• Forged in Europe end-to-end and is deployable from Europe via our own Mistral Cloud infrastructure.
• Available to all via API today. Working with cybersecurity partners privately.
Open weights release end of October.
🤖 Made with AI
La baisse tendancielle des scores PISA est une alerte. Une catastrophe ? Pas forcément.
Si on la traduit par analogie avec la distribution des tailles en France, la baisse correspondrait à peine à quelques millimètres : presque imperceptible à l'oeil nu.
Julien Tap retweeted
Cette infographie est à la fois spectaculaire et pédagogique. Les paysages français de notre enfance ne seront plus ceux de demain.
En représentant la dérive géographique de la température moyenne de plusieurs villes françaises et espagnoles, cette infographie illustre les bouleversements biogéographiques à venir, et notamment le déplacement des aires de répartition des cultures en France.
Dans un scénario de réchauffement modéré (SSP370), la température moyenne de Barcelone se retrouve à Niort. Celle de Toulouse dans les Alpes. Celle de Cordoue à Perpignan.
Nos forêts ne seront plus composées des mêmes essences. Les cultures ne seront plus cultivées aux mêmes endroits. Je crois que nous n'avons pas encore pleinement pris conscience de l'ampleur de la révolution paysagère qui s'annonce.
Cette transition ne se fera pas sans difficultés. Pour l'agriculture, le déplacement des filières nécessitera des investissements considérables, des décennies d'adaptation et une profonde réorganisation des territoires. Pour les forêts, la situation est encore plus complexe : avant l'installation de nouvelles essences, une phase de dépérissement parfois massif des espèces actuellement présentes est déjà en cours.
Les espèces forestières migrent naturellement vers le nord et en altitude, mais beaucoup trop lentement face à la vitesse du réchauffement climatique. L'évolution du climat dépasse désormais leur capacité naturelle de dispersion. Dans de nombreuses régions, une migration assistée, réfléchie et scientifiquement encadrée, deviendra probablement indispensable pour préserver les écosystèmes forestiers de demain.
N.B. : je regarde uniquement la température moyenne pas les précipitations ou autres caractéristiques de climat.
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5 jours de travail et des millions de données analysées. Je peux enfin répondre à deux questions :
➡️Comment qualifier la sécheresse de 2026 ?
➡️Et surtout, comment les sécheresses évoluent elles en France ?
Je vous présente les résultats dans ce thread richement illustré.
1/10
Bad day today for all monarchies
Happy #bastilleday to all
Allez les bleus ! #fraesp
Liberté, Égalité, Fraternité
Mbappé, Olise, Dembelé 😉
espérons que le match #frapar soit un vaccin pour la FIFA et les arbitres si d'autres équipes adoptent une attitude similaire de l'équipe du Paraguay
Julien Tap retweeted
Last year CroCoDeEL was released, and now it is out in @NatureComms! 🐊🎉
We also designed a webapp to explore CroCoDeEL results: scatterplots, networks, plates, verdicts, and clean reports. Try it out! 💻📊
Paper: nature.com/articles/s41467-0…
🖥️: metagenopolis.github.io/CroC…
1/9 🚨 New preprint alert!
Frustrated by strange results with your metagenomic data?
Meet CroCoDeEL, an accurate, easy-to-use tool to detect and quantify cross-sample contamination—no need for negative controls or sample positions!
🔗 doi.org/10.1101/2025.01.15.6…
🔴 INFO BFMTV
Hantavirus: une vingtaine de cas contact identifiés sur le territoire français
l.bfmtv.com/C1ys
Julien Tap retweeted
Why do some people develop bloating with some carbohydrates?
We examined clinical, diet, microbiome & meta-transcriptome in those bloating induced by either:
Fructans ➡️Abdominal girth, F:B ratio, CAZyme
GOS ➡️Breath H2, GABA
Paper @AmJGastro
journals.lww.com/ajg/fulltex…
#DDW2026
Julien Tap retweeted
📣 We're hiring a Postdoc in Microbiome Bioinformatics — Paris, Sorbonne Université / AP-HP
If shotgun metagenomics is your thing, read on 🧵
can't wait to reinstall back mandrake ^^ #linux
France is transitioning government desktops to Linux, with each ministry required to formalize its implementation plan by autumn 2026.
linuxiac.com/france-launches…
#Linux #OpenSource
Julien Tap retweeted
What a sad news, and a big loss to his family, EMBL, and the whole microbiome field. 🙏 embl.org/news/embl-announcem…
Julien Tap retweeted
20 | Peer Bork and the scientific candy shop
Apple: podcasts.apple.com/us/podcas…
Spotify: open.spotify.com/episode/17u…
Julien Tap retweeted
With great sadness I just got to know the passing of Peer Bork (embl.org/news/embl-announcem…) . I very vividly remember when he hosted me in his lab as a visiting PhD student on our mycoplasma collaboration. He was one of the very inspiring figures I had during my PhD. Such a brilliant scientist. Huge loss.
Julien Tap retweeted
What sad news...
Peer was a giant of bioinformatics and computational biology and an inspiring mentor to everyone who had been in his group
embl.org/news/embl-announcem…
Julien Tap retweeted
Very sad news. I greatly enjoyed meeting and interacting with Peer back in my @Nature days (and still owe him a beer). My thoughts are with his family, friends and colleagues.
embl.org/news/embl-announcem…





















